ভারতের ফারাক্কা বাঁধের বিরূপ প্রভাব আর দখলদারদের নগ্ন থাবায় অস্তিত্ব হারাতে বসেছে কুষ্টিয়া জেলার ওপর দিয়ে প্রবাহিত ৮টি নদী। এক সময়ের খরস্রোতা এসব নদী এখন মরা খালে পরিণত হয়েছে। কোথাও নদী দখল করে বাড়িঘর আবার কোথাও স্থাপন করা হয়েছে দোকানপাট। আবার কোথাও ইচ্ছামতো বাঁধ দিয়ে বন্ধ করে দেওয়া হয়েছে নদীর স্রোতধারা। এখন আর বোঝার উপায় নেই, এক সময় এসব নদীতে বড় বড় পাল তোলা নৌকা আর লঞ্চ, স্টিমার চলত।

পদ্মার অন্যতম শাখা গড়াই ও মাথাভাঙ্গা নদীর উৎপত্তিও এ জেলায়। ভারত পদ্মানদীর উজানে ফারাক্কা বাঁধ দিয়ে পানি প্রত্যাহার করায় দেশের দীর্ঘ ও বৃহত্তম পদ্মানদী আজ হুমকির মুখে। ভারতের সঙ্গে ঐতিহাসিক গঙ্গার পানি বণ্টন চুক্তি হলেও বিগত কয়েক বছর ধরে নানা অজুহাতে ভারত পানির ন্যায্য হিস্সা দিচ্ছে না। এতে নদীর অবস্থা দিনকে দিন সঙ্গীন হচ্ছে। এর মারাত্দক প্রভাব পড়েছে গড়াই ও মাথাভাঙ্গা নদী এবং এর শাখা, উপশাখা নদী ও বিল-হাওরগুলোর ওপর। নদীতে পানি প্রবাহ না থাকায় দিন দিন এসব নদী ভরাট হয়ে যাচ্ছে। এ সুযোগে ভূমিদস্যুরা নদীর দুই পাড় দখল করে নিচ্ছে।