১৭৮৫ সাল পর্যন্ত হেস্টিংস গভর্নর জেনারেল হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন। শেষ বছরগুলোয় তিনি যেসব অসুবিধার সম্মুখীন হন তা ছিল মূলত যুদ্ধকেন্দ্রিক। ১৭৭৮ সাল থেকে ব্রিটিশরা মারাঠাদের সঙ্গে যুদ্ধে লিপ্ত হয়। ১৭৮০ সালে শক্তিশালী মহিশূর বাহিনী ব্রিটিশ আশ্রিত কর্নাট অঞ্চল আক্রমণ করে। ১৭৮১ সালের জানুয়ারিতে একদল ফরাসি সৈন্য মহিশূরের সাহায্যার্থে ভারতে পদার্পণ করে।

হেস্টিংস কূটকৌশলে ভারতীয় মৈত্রী জোটকে ভেঙে দিতে সক্ষম হন। তিনি প্রচুর অর্থ, রসদ ও সৈন্যবাহিনী বাংলা থেকে মাদ্রাজে পাঠান। এর ফলে মহিশূর বাহিনীকে পিছু হটতে হয় এবং ফরাসি বাহিনীকে প্রতিরোধ করা সম্ভব হয়। সংগত কারণেই ভারতে ব্রিটিশ সাম্রাজ্যের ত্রাণকর্তা হিসেবে হেস্টিংস নিজেকে দাবি করতে পারেন।  তা সত্ত্বেও যুদ্ধের কারণে স্বদেশে হেস্টিংসের ব্যাপক সমালোচনা হয়। তিনি একজন যুদ্ধংদেহি মনোভাবাপন্ন শাসক হিসেবে চিত্রিত হন। অভিযোগ ওঠে, ধ্বংসাত্মক ব্যয়বহুল যুদ্ধে কোম্পানির জড়িয়ে পড়ার জন্য তিনিই দায়ী। যুদ্ধের প্রয়োজনে হেস্টিংস কোম্পানির উত্তর ভারতীয় কিছু মিত্রশক্তি ও আশ্রিত রাজ্যের সঙ্গে বিরোধে জড়িয়ে পড়েন। বেনারসের রাজা চৈৎ সিংহ কোম্পানিকে অতিরিক্ত কর দিতে বাধ্য হন। তিনি কোম্পানির ন্যায়সংগত দাবি মেটাতে গড়িমসি করছেন- এ অজুহাতে ১৭৮১ সালে হেস্টিংস স্বয়ং চৈৎ সিংহের রাজ্যে উপনীত হয়ে তাঁর ওপর বিপুল অঙ্কের জরিমানা ধার্য করেন। রাজার রক্ষীদল ক্ষুব্ধ হয়ে উঠলে হেস্টিংসকে পালিয়ে প্রাণ বাঁচাতে হয়।