অনিয়মের আশ্রয় নিয়ে নির্বাচন আয়োজন করতে যাওয়ার অভিযোগে বগুড়া ইসলামিক স্টাডিজ গ্রুপের নির্বাচনে স্থগিতাদেশের জন্য আদালতে মামলা করা হয়েছে। একই দাবিতে বগুড়া জেলা প্রশাসকের কাছে একটি আবেদনও জমা দেওয়া হয়েছে। প্রতিষ্ঠানের আজীবন সদস্য মো. মাহমুদুর রহমান, অধ্যক্ষ মাও. মো. আবু নছর ইয়াহিয়া ও মো. আবদুল হান্নান যৌথভাবে এ মামলাটি করেন। মামলায় বিবাদী করা হয় বগুড়া ইসলামিক স্টাডিজ গ্রুপের সভাপতি, সম্পাদক এবং নির্বাচন পরিচালনা কমিটির আহ্বায়ক মো. আতোয়ার রহমান, নির্বাচন কমিটির সদস্য কে বি এম মুসা ও মো. খবিরুল ইসলামকে। মামলায় বলা হয়েছে, ৭ জুলাই ২০২ চলমান কমিটির মেয়াদ শেষ হয়। এ কমিটি কোনো আহ্বায়ক না করে নির্বাচন পরিচালনা কমিটি গঠন করে। নিয়ম মাফিক আহ্বায়ক কমিটি গঠন করে নির্বাচন আয়োজন করা হয়নি। নিজেদের স্বার্থে ভোটার তালিকা করে এ নির্বাচন আয়োজন করা হয়েছে। নতুন করে কোনো সদস্য করা হয়নি। বগুড়া শহর জামায়াতের সাবেক সেক্রেটারি ও ইসলামী চিন্তাবিদ এ বি এম মাজেদুর রহমান জুয়েল জানান, যারা বগুড়া ইসলামিক স্টাডিজ গ্রুপের সদস্য তাদের অনেকেই মুসলমান সমাজের জন্য তেমন কোনো গবেষণা করেন না। প্রতিষ্ঠানে নতুন সদস্য না করার জন্য একটি লিখিত কাগজ করা হয়েছে। নতুন সদস্য না নিলে তরুণ প্রজন্ম কী করে এ প্রতিষ্ঠানের সঙ্গে কাজ করবে?