মেঘনা নদীর উৎপত্তি ভারতের শিলং ও মেঘালয় পাহাড়ে এবং এর প্রধান উৎস বরাক নদী; যা সিলেট জেলায় বাংলাদেশের সীমান্তে দুই ভাগে বিভক্ত হয়ে সুরমা ও কুশিয়ারা নামে বাংলাদেশে প্রবেশ করেছে। সুরমা ও কুশিয়ারা পুনরায় মারকুলির কাছে মিশে মেঘনা নামে ভৈরব হয়ে চাঁদপুরে পদ্মা নদীর সঙ্গে মিলিত হয়েছে। বরাক-মেঘনার মিলিত দৈর্ঘ্য ৯৫০ কিলোমিটার, যার প্রায় ৩৪০ কিলোমিটার বাংলাদেশে অবস্থিত। এ ছাড়াও এই নদী প্রণালির নিষ্কাশন এলাকার মোট আয়তনের প্রায় ৩৬ হাজার বর্গকিলোমিটার বাংলাদেশে অবস্থিত। ত্রিপুরা পাহাড় থেকে উৎপন্ন গোমতী ও খোয়াই নদী মেঘনার প্রধান উপনদী। এ অববাহিকার প্রধান নদীগুলো হলো- বরাক, সুরমা, কুশিয়ারা, বাউলাই, তিতাস ইত্যাদি।